No ano de 1901, o missionário Charles E. Cowman e sua esposa Lettie Cowman, receberam de Deus a visão de evangelizar o Japão, sendo ajudados pelo pastor Nakada. Um ano mais tarde, sentiram este mesmo chamado o missionário Kilbourne e sua esposa. A consagrada obediência desses dois casais, guiados por Deus, resultou na fundação da Sociedade Missionária Oriental (*) e da criação de Igrejas no Japão, Coréia e China, realizando um tríplice programa:

1. Literal cumprimento da Grande Comissão de nosso Senhor Jesus Cristo, na proclamação do Evangelho a toda a criatura;
2. A preparação de um ministério nativo;
3. O estabelecimento de Igrejas locais.

Em 1925 alguns imigrantes japoneses convertidos vieram para o Brasil e aqui formaram várias Igrejas entre as colônias nipônicas, tornando-se autônomas da Igreja do Japão em 1934, com o nome de Igreja Evangélica Holliness do Brasil, continuando seus trabalhos somente entre os japoneses. Em 1950, chegaram ao Brasil os primeiros Missionários da Sociedade Missionária Oriental (depois de já começado seus trabalhos na Colômbia e Equador), compraram algumas propriedades em Maringá e, em Londrina, fundaram (em alguns países é chamado OMS Internacional) o lSBL - Instituto e Seminário Bíblico de Londrina, com o alvo de treinar obreiros brasileiros para a Igreja e Pátria brasileira.
Em 1956, além dos trabalhos já iniciados aqui pela Missão, liderada pelo missionário Dr. B.H. Pearson, pequenos grupos de irmãos que pertenciam à Igreja "Casa de Oração" em Iguaraçú, Londrina e Maringá e da Igreja Evangélica de Suzano e da Igreja Holliness (brasileiros) de Presidente Prudente-SP, se filiaram à Missão. Por iniciativa do DR. B.H. Pearson e com os entendimentos feitos com a Igreja Evangélica Holliness do Brasil, que aqui existia entre os japoneses, foi criada a "Ala Brasileira" da referida Igreja , com o propósito de estender os trabalhos entre os brasileiros e amparar organicamente as Igrejas fundadas e recebidas pela Missão, continuando esta com seu apoio e seu auxílio.
Em 1958, devido o crescimento da “Ala Brasileira” da Igreja Evangélica Holiness do Brasil, surgiu a necessidade de reunir em separado as Igrejas desta "Ala" e organizar uma Junta Administrativa para melhor coordenação e maior desenvolvimento de setor. Isto se deu em 07 de janeiro, com a eleição da primeira Junta Administrativa da "Ala Brasileira", continuando com eleição em cada ano, mesmo pertencendo ainda à Igreja Evangélica Holliness do Brasil.
Em 1.962, no dia 10 de janeiro, entendendo não ser prejudicial à "Ala Japonesa" e nem à Sociedade Missionária Oriental, mediante entendimentos pré-estabelecidos, foi desmembrada a "Ala Brasileira”, tornando-se uma entidade distinta das demais, independente em seu governo, patrimônio e administração, permanecendo, contudo, a unidade histórica, unidade de comunhão cristã, princípios doutrinários e o propósito de evangelizarem a pátria brasileira e além.
No dia 27 de Julho de 1962, em Concílio extraordinário e por decisão unânime do plenário, o nome "Ala Brasileira" da Igreja Evangélica Holliness do Brasil foi mudado para o nome de “Igreja Missionária”. No ano de 1.965. em 13 de dezembro, foi registrada, juridicamente, como Associação das Igrejas Missionárias, hoje, “Convenção Nacional das Igrejas Missionárias” CONIM.

ALVOS E OBJETIVOS

1. A visão da Santidade de Deus em contraste com a pecaminosidade do coração humano;
2. Conhecimento profundo da obra Redentora de Cristo e do poder do Espírito Santo para salvar o homem do seu pecado e capacitá-lo a viver santamente para Deus, Livre do fanatismo e livre também do criticismo e diferentismo dos cristãos nominais;
3. Visão das almas perdidas em todo o mundo e da urgente necessidade de alcançar o maior número possível de pessoas para Deus com a pregação do Evangelho;
4. Formação de Igrejas locais, com sustento próprio à medida que o Senhor for abrindo as portas.

Para os alvos e objetivos acima são necessários:

1. Preparar cada membro da Igreja local para ser um missionário autêntico, um sacerdote, um evangelista, um ganhador de almas segundo os princípios da Santa Palavra de Deus, a Bíblia;
2. Ensinar que isso acontecerá quando todos forem cheios do Espírito Santo e inteiramente Santificados;
3. Pregar as doutrinas da regeneração pela fé em Jesus, da inteira Santificação pelo Batismo do Espírito Santo, da cura Divina, e da segunda vinda de Cristo para arrebatar a sua Igreja;
4. Reunir todos os esforços possíveis para manter a vida espiritual profunda através de encontros de avivamento, dias de oração e jejum, noites de vigília e outras reuniões espirituais;
5. Tudo fazer para preparar o maior número possível de obreiros cheio do Espírito Santo e com finalidade de organizar igrejas locais fortes e com visão missionária.

LINHA DE GOVÊRNO E DOUTRINA

A Igreja Missionária nasceu da experiência cristã e de maneira espontânea, adotando uma forma própria de governo, ou seja, um sistema intermediário entre o governo episcopal, presbiteriano e congregacional . Doutrinamente procura estabelecer uma linha bíblica de centro, sem pender para o tradicional modernista ou para o pentecostal extremista. Portanto, a Igreja Missionária não aceita o rótulo de "tradicional" ou de "pentecostal" (terminologias não-bíblicas), mas busca caracterizar-se como "Cristãos Bíblicos" (Atos 17:11 e 11:6), esforçando-se por estabelecer um equilíbrio entre os extremos do indiferentismo à obra do Espírito Santo e dos que, em nome dela, cometem abusos e aberrações.